MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_9p

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018886	A	7	7	8	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018886	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018886	AT	3	6	90	95	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018886	A	6	6	1363	1368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018886	TAA	2	6	1393	1398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018886	ACTG	2	8	1403	1410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018886	TTATT	2	10	1430	1439	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018886	GCA	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018886	T	7	7	1477	1483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018886	TTAAAT	2	12	1509	1520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018886	ATTT	2	8	1536	1543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018886	AT	3	6	1561	1566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018886	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018886	T	7	7	1628	1634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018886	AT	4	8	1639	1646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018886	T	6	6	1666	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018886	GAT	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018886	T	7	7	1677	1683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018886	T	6	6	1731	1736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018886	GATTT	2	10	1743	1752	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018886	TCTTT	2	10	1808	1817	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018886	TA	3	6	1847	1852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018886	A	6	6	1878	1883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018886	TG	3	6	1950	1955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018886	TTG	2	6	1985	1990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018886	T	6	6	2001	2006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018886	A	6	6	2075	2080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018886	AT	3	6	2109	2114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018886	AT	3	6	2117	2122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018886	ATG	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018886	A	6	6	2151	2156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018886	A	6	6	2172	2177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018886	A	6	6	2185	2190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018886	T	6	6	2199	2204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018886	T	7	7	2500	2506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018886	TA	3	6	2545	2550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018886	ATA	2	6	2603	2608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018886	AT	3	6	2614	2619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018886	AT	3	6	2649	2654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018886	A	6	6	2655	2660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018886	ATT	2	6	2671	2676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018886	GTAA	2	8	2710	2717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018886	TGAA	2	8	2732	2739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018886	ATG	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018886	T	8	8	3066	3073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018886	TAG	2	6	3221	3226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018886	TGA	2	6	3246	3251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018886	T	7	7	3283	3289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018886	TA	3	6	3359	3364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018886	AAAAT	2	10	3413	3422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018886	CAA	2	6	4686	4691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018886	ATT	2	6	4716	4721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018886	TAT	2	6	4754	4759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018886	AAT	2	6	4768	4773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018886	CTTATT	2	12	5604	5615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018886	TAT	2	6	5619	5624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018886	A	7	7	5675	5681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018886	T	6	6	5707	5712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018886	GAC	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018886	A	6	6	5820	5825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018886	T	7	7	5836	5842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018886	CAC	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018886	T	7	7	5996	6002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018886	T	7	7	6032	6038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018886	TGA	2	6	6254	6259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018886	A	8	8	6302	6309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018886	AGT	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018886	ATG	2	6	6599	6604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018886	T	8	8	6810	6817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018886	CGG	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018886	A	7	7	6920	6926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018886	T	6	6	8161	8166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018886	T	6	6	8168	8173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018886	T	6	6	8199	8204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018886	A	8	8	8250	8257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018886	A	8	8	8270	8277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018886	T	7	7	8309	8315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018886	T	6	6	8343	8348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018886	CTTT	2	8	8349	8356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018886	A	9	9	8432	8440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018886	GAG	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.